當發現氣體的純度足以影響在線色譜儀的分析時，除了以更高的純度代替氣體以外，還可以從以下幾個方面進行處理：

　　1、分析目標。

　　不應在高溫下容易發生氧化和水解的環境中進行操作，以防止樣品成分變形甚至消失，從而影響氣相色譜結果的分析。

　　2、儀器系統。

　　在安裝在線色譜儀之前，必須清潔載氣和輔助氣體的管道，并且該氣體必須配備過濾和凈化設備，以吸收氣體中剩余的干擾成分。同時，要注意過濾和凈化設備是否無效，并防止由于氣路控制閥的污染而導致調節精度下降，從而影響儀器的靈敏度，損害儀器。
 

　　3、色譜柱。

　　為了防止雜質的影響，可以在分析柱的前面連接相同類型色譜柱的一部分作為保護柱。一段時間后，可以更換前端保護柱，以防止縮短分析柱壽命。可能在運行一段時間后，將分析柱切掉約1m，以除去功能降低的色譜柱部分。

　　4、色譜圖。

　　如果發現載氣或輔助氣體的純度不夠，可用溶劑空白樣品扣除空白光譜。

　　5、檢測儀器。

　　在線色譜儀運行一段時間后，應將檢測器老化。如有必要，需要拆卸和清潔它，以去除由于載氣和輔助氣體不純而殘留在檢測器中的干擾雜質。